在“春天”里煥發(fā)水稻種子“活力”
2022-04-28
農(nóng)以種為先。對于水稻而言,種子活力就如種子質(zhì)量的“晴雨表”,但長期以來,人們對種子活力的“運營機制”知之甚少。
在2月21日發(fā)表于美國《國家科學院院刊》的一項研究中,中國科學院植物研究所研究員宋獻軍、副研究員王偉青等經(jīng)過近5年的研究,揭示了活性氧清除途徑改善水稻種子活力的新機制,為進一步改良作物品質(zhì)提供了理論依據(jù)和有用的靶標。
研究的“春天”
俗話說,“種子不好,豐收難保”。種子活力是種子質(zhì)量的重要指標之一,活力越高的水稻種子質(zhì)量也越高。
種子活力通常是指種子的萌發(fā)活力,以及貯藏中保持這種活力的能力。這一重要的農(nóng)藝性狀對于種子質(zhì)量和種質(zhì)資源保存具有重要意義。但是,目前關(guān)于作物種子活力的調(diào)控機制和分子網(wǎng)絡(luò)的研究非常缺乏。
宋獻軍告訴《中國科學報》,植物種子活力一般在剛收獲時較高,在隨后的貯藏過程中逐漸降低,直至喪失。而活力喪失的快慢與存放環(huán)境直接相關(guān)。“種子收獲后能夠保持高活力的時間越長,種子活力就越高,在種子市場上就越受歡迎。”宋獻軍說。
然而,種子活力不僅由遺傳因素決定,還受環(huán)境因素大影響,具有多基因控制的特征。因此,揭示種子活力性狀的調(diào)控機制有很大難度。
宋獻軍表示,雖然科研人員已經(jīng)利用模式植物擬南芥鑒定到一些遺傳因子,例如編碼過氧化物酶的基因和植物激素脫落酸(ABA)途徑中的一些轉(zhuǎn)錄因子等,并發(fā)現(xiàn)它們對調(diào)控種子活力有重要作用,但并不清楚這些基因間是否存在某種生物化學、分子調(diào)控和遺傳上下游等關(guān)系,進而產(chǎn)生內(nèi)在聯(lián)系,形成調(diào)控的分子網(wǎng)絡(luò),并最終決定種子活力。
與擬南芥相比,水稻作為生長周期更長的作物,其種子活力的研究難度更大。“近年來,得益于作物基因組學和功能基因?qū)W的快速進展,作物種子活力的科學研究迎來了新的春天。”宋獻軍說。
兩個“**”中找答案
為找到?jīng)Q定亞洲栽培稻種子活力的關(guān)鍵基因,宋獻軍團隊建立并完善了水稻種子人工老化實驗體系,測定了兩種栽培稻生態(tài)型(粳稻和秈稻)的600多個品種的種子活力表型。
一般情況下,種子活力可以通過檢查在特定環(huán)境下存放后的種子的萌發(fā)能力進行判斷。但自然條件下,不同水稻品種的種子一般需1~3年才能**喪失活力,持續(xù)時間較長。因此,科研人員往往利用人工加速種子老化實驗,對種子活力性狀進行檢測和分析。
然而,建立成熟穩(wěn)定的人工老化實驗平臺并非易事。論文作者王偉青告訴《中國科學報》,種子活力表型會受溫度和濕度等嚴重影響。例如,在田間條件下,種子活力受環(huán)境因素影響,種子成熟時高溫多雨的天氣將嚴重影響種子活力的測定。經(jīng)過一段時間摸索后,他們終于建立了成熟穩(wěn)定的水稻種子人工老化實驗體系。
在對600多個品種的種子活力表型進行分析后,他們發(fā)現(xiàn)了兩個種子活力差異巨大的水稻品種——低活力的“吉粳88”和高活力的“Kasalath”。研究發(fā)現(xiàn),在同樣條件下老化處理12天后,“Kasalath”品種仍然能夠保持98.7%的萌發(fā)率,而“吉粳88”品種則**喪失了萌發(fā)能力。
這讓研究人員陷入了思考,造成這種巨大差異的原因是不同的基因表達水平嗎?為此,研究人員利用高通量轉(zhuǎn)錄組學和廣靶代謝組學技術(shù),分別分析并比較這些品種種子老化過程中的轉(zhuǎn)錄組和代謝組的改變。但在這個過程中,他們發(fā)現(xiàn)超過6000個基因的轉(zhuǎn)錄表達發(fā)生了改變。
從海量基因中找到關(guān)鍵調(diào)控因子可謂“大海撈針”。為此,研究人員通過搜索相關(guān)文獻和不斷學習,最終成功構(gòu)建了共表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并篩選到兩個特殊的轉(zhuǎn)錄因子——bZIP23和bZIP42。它們與很多差異表達基因間存在關(guān)聯(lián),這暗示它們可能是關(guān)鍵的調(diào)控因子。
果不其然。通過對bZIP23和bZIP42轉(zhuǎn)基因水稻的分析,研究人員發(fā)現(xiàn),這些基因的功能缺失降低了種子活力。也就是說,bZIP23和bZIP42對種子活力有正向調(diào)控作用。
關(guān)鍵“角色”
結(jié)合其他研究結(jié)果,研究人員還發(fā)現(xiàn)一個關(guān)鍵“角色”——編碼過氧化物酶的遺傳因子PER1A,該因子編碼蛋白能夠通過清除種子內(nèi)的活性氧正向調(diào)控種子活力。那么,轉(zhuǎn)錄因子bZIP23和bZIP42與PER1A會存在內(nèi)在關(guān)聯(lián)嗎?
這一猜想得到了證實。研究人員發(fā)現(xiàn)這兩個轉(zhuǎn)錄因子能夠直接結(jié)合到PER1A的啟動子區(qū),并激活PER1A的轉(zhuǎn)錄表達。遺傳學證據(jù)表明,PER1A很可能位于bZIP23的下游,在同一遺傳通路中發(fā)揮調(diào)控種子活力的生物學功能。此外,生理學數(shù)據(jù)也表明,bZIP23和PER1A在清除體內(nèi)的活性氧過程中發(fā)揮著重要作用。
宋獻軍告訴記者,雖然之前已有研究發(fā)現(xiàn)了活性氧在細胞內(nèi)作用的兩面性:較低濃度下,活性氧可以作為信號分子,參與調(diào)控種子發(fā)育、休眠和發(fā)芽;較高濃度下,活性氧會變成有害物質(zhì),對細胞和組織產(chǎn)生損傷,降低種子活力。但是,關(guān)于活性氧清除途徑調(diào)控種子活力的分子網(wǎng)絡(luò)研究卻鮮有報道。
這項研究不僅發(fā)現(xiàn)了bZIP23-PER1A模塊調(diào)控水稻種子活力,還發(fā)現(xiàn)ABA信號途徑可能參與了這一過程,為深入理解作物種子活力的調(diào)控機理提供了重要參考。
宋獻軍表示,團隊接下來將以這一調(diào)控模塊為起點,繼續(xù)設(shè)計和開展實驗,深入揭示ABA信號途徑在水稻種子活力調(diào)控中的機制,還將探索其他植物激素途徑在種子活力控制中是否及如何發(fā)揮重要的生物學功能。
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